在喬納森擊敗迪奧的一百年後，迪奧從大西洋裡甦醒了！而喬瑟夫的外孫空條承太郎發現了自己有幽波紋的能力，迪奧的復活威脅到了承太郎母親的性命，為了母親，他決定跟著夥伴們一起前往埃及打倒迪奧…